Že od samega začetka menstruacije, ženska začenja izmeriti jutranjo temperaturo po spanju. Izmeri se najpogosteje pod jezikom, približno 12 dni pa bo bazalna temperatura približno 36,5 stopinj. Potem je mogoč majhen padec bazalne temperature za en dan in z nastopom ovulacije se časovni razpored spremeni: potem se bazalna temperatura dvigne za 0,4 stopinj ali več - od 37 stopinj (in morda 37-38, za različne ženske na različne načine). To se zgodi pred menstruacijo, pred katerim se pojavi drugo zmanjšanje bazalne temperature.
Ko je ženska oplojevala jajce, bazalna temperatura ne pade ob zamiku menstruacije, je nad 37 stopinj, vendar ni menstruacije. Včasih po implantaciji zarodka bazalna temperatura celo naredi oster skok navzgor (37-38 stopinj). Vse njegove spremembe so lahko informativne do 20 tednov nosečnosti, običajno ne merijo več.
Vedno ni vedno izhodiščna temperatura med nosečnostjo, samo ne pada in mesečno se ne začne. Po zasnovi se običajno začne naraščanje bazalne temperature med nosečnostjo, ki traja več kot 18 dni (od 37,1 do 37,3 stopinj).
Če je povišanje bazalne temperature med nosečnostjo različica norme, potem je njegovo zmanjšanje zelo slab prognostični znak. Zmanjšanje bazalne temperature med diagnosticirano nosečnostjo lahko kaže na nosečnost, ki se ne razvija in smrt zarodka. Vendar je bazalna temperatura informativna le v času zgodnje nosečnosti (do 20 tednov), od takrat se začne znova upadati. Po 21 tednih brejosti je bazalna temperatura običajno pod 37 stopinj, zdaj pa to sploh ni znak nevarnosti splava.
Če se po začetku nosečnosti bazalna temperatura rahlo zmanjša, lahko to kaže na zmanjšanje ravni progesterona in tveganja splavov. Ampak, če se bazalna temperatura zmanjša na 0,8-1 stopinje in ostane na tej ravni, je to znak izgubljenega splava in morate takoj opraviti ultrazvočni pregled (preverite, ali se oplojeno jajce in zarodek rastejo, če pride do srčnega utripa in gibanja ploda). In bazalna temperatura pri jemanju zdravila Duphaston ali Utroshestan se lahko podaljša in z nosečnostjo, ki ni v razvoju.