V Ljubljani Estonije neprekinjeno komuniciranje z letalom je bilo vzpostavljeno tako z regijami znotraj njene države kot s številnimi svetovnimi prestolnicami in velikimi mesti. Nekatera letališča v Estoniji imajo sovjetsko preteklost, potem ko so zapustili strukturo Unije, so bile administrativne zgradbe, vzletno-pristajalne steze, letala in vozni parki večkrat posodobljeni in rekonstruirani v skladu s sodobnimi standardi.
Sodobna Estonija služi pet letališč, od katerih so tri mednarodne. Ker ima država dostop do Baltskega morja, Finske in Riški zaliv , v svoji sestavi so otoki Saareme in Hiiumaa, potem so potrebni redni leti, ki povezujejo otoke s celino.
Mednarodna letališča v Estoniji izpolnjujejo vse standarde za sprejem in vzdrževanje letov na dolge razdalje. Estonska služba za zračno plovbo je v celoti v lasti države in strogo nadzira varnost in kakovost storitev potnikov.
1. Letališče Talin . Največje letališče v državi je glavno letališče v Talinu - Iulemiste. Nahaja se v mestnih mejah, le 4 km od centra mesta. Prvič se je odprla in začela obratovati leta 1936, od takrat so bile organizirane številne rekonstrukcije, leta 2009 pa je bilo popolnoma prenovljeno, potem pa je postalo eno od večjih glavnih letališč v Evropi. Po končani prenovi je letališče dobilo uradni status mednarodnega letališča Estonije, poimenovane po enem od predsednikov države - Lennart Mary.
Nedaleč od Yulemiste je glavno pristanišče države. Letališče ima take značilnosti:
Z letališča ulemiste je javni prevoz, tako da sta avtobusi 2 in 65 zlahka dostopni do središča mesta.
2. Letališče Tartu . Tartu je drugo največje mesto v Estoniji. Mestno letališče je bilo zgrajeno leta 1946 v bližini vasi Yulenurme, zaradi česar še vedno neuradno imenujemo ta naselja. Nahaja se 9 km od središča Tartuja.
Že dolgo, ko se je Estonija umaknila iz ZSSR na letališču Tartu, ni bilo rednih letov, se je v Estoniji štelo za dodatno mednarodno letališče. Po letu 2009 redni leti Flybe Nordic na Finsko šestkrat na teden s svojega ozemlja.
Novi potniški terminal Yulenurme je bil zgrajen leta 1981, leta 2005 pa je bil terminal preurejen, dolžina vzletno-pristajalne steze pa se je povečala za 1800 m.
Nedaleč od letališča Tartu je estonska letalska akademija.
3. Letališče Pärnu . Letališče se nahaja v majhnem odmiku od mesta Pärnu, je bilo zgrajeno leta 1939. Po vstopu Estonije v ZSSR se je letališče Pärnu uporabljalo kot vojaško letališče. Toda od poletja leta 1992 se je novo ustanovljeno estonsko ministrstvo za obrambo odločilo, da letališče prenese za potrebe civilnega letalstva. Do leta 1997 je bila izvedena rekonstrukcija vzletno-pristajalne in upravne stavbe.
Danes letališče Pärnu obvezuje oba redna letala znotraj države in mednarodno komuniciranje s Švedsko, ki potujejo in letijo na teden v Stockholmu.
4. Letališče Kuressaare . Letališče Estonije Kuressaare služi domačim letom, se nahaja na otoku Saaremaa. Njegova uradna otvoritev je bila leta 1945, od takrat pa se postopoma izvaja rekonstrukcija. Sedanja stavba potniškega terminala je bila odprta leta 1962. Danes Kuressaare redno odhaja, ko povezuje otok z glavno državo, pa tudi med turistično sezono nadaljuje letove na estonski otok Ruhnu.
5. Letališče Kärdla . Letališče Kärdla se nahaja na drugem največjem estonskem otoku Hiiumaa, nedaleč od mesta Kärdla z istim imenom. Odprt je bil leta 1963 in aktivno potoval v Talin , Tartu , Vormsi, Haapsalu , Kaunas, Murmansk in Riga . Po nakupu Estonija Letališče Kärdla je znatno zmanjšalo število letov. Danes ta letalski terminal deluje gladko in redno, pri čemer potuje iz Talina.