Pogosto pri opravljanju pregleda na ginekološkem stolu zdravnik predpiše analizo, ki določa stopnjo čistosti vagine. Po tej definiciji v ginekologiji se pogosto razume sestava mikroflore, ki je izražena glede na koncentracijo koristnih mikroorganizmov na patogene in pogojno patogene.
Vzpostavitev tega parametra, na katerem je neposredno odvisna stanje ženskega reprodukcijskega sistema, se opravi s pomočjo brisov, da se določi stopnja čistosti vagine.
Skupaj, pri ocenjevanju stanja vaginalne flore, zdravniki razlikujejo 4 stopinje.
Za 1 stopnjo čistosti vagine je značilna prisotnost ženskega reprodukcijskega organa Doderleinovih palic in laktobacilov. Ti mikroorganizmi so osnova za zdravo vagino. Hkrati je okolje kislo. Ni patogenih mikrobov, krvnih celic, zlasti levkocitov.
2 stopinj čistosti ženske vagine se nahaja pri večini žensk v rodni dobi, ker Prva stopnja je zelo redko opazovana zaradi spolne aktivnosti, kršitve higienskih pravil in drugih dejavnikov, ki prispevajo k pojavu pogojno patogene flore. Za to stopnjo čistosti je značilna prisotnost istih palčk Doderleina, laktobacilov. Kokci pa so prisotni v enem samem znesku. Poleg tega je lahko največ 10 levkocitov in največ 5 epitelijskih celic.
3 stopinjo čistosti vagine je značilna prisotnost v reproduktivnem sistemu vnetnega procesa. V tem primeru se medij spremeni v alkalno, število palic Doderlein pa se močno zmanjša. Ob istem času se taki patogeni mikroorganizmi povečajo kot: streptokok, Stafilokoki, glive, E. coli. Število levkocitov se poveča in na področju mikroskopa lahko laboratorijski tehnik šteje do 30 takih celic. To stopnjo čistosti vagine praviloma spremljajo simptomi, na primer izcedek in srbenje.
Stopnja 4 je opazna pri bakterijski vaginozi ali v kužnem procesu. Medij je alkalen, palčke Doderlein pa so popolnoma odsotne. Hkrati celotno floro predstavljajo patogeni mikroorganizmi, kar vodi do povečanja števila levkocitov - najdenih jih je več kot 50. S 3 in 4 stopinjami čistosti vagine potrebuje ženska zdravljenje.