Sistem ločene prehrane je trenutno sporen, saj niso vsi procesi v telesu, ki so postavljeni v ospredje, znanstveno dokazani. Vendar pa so načela ločene prehrane za dolgo časa priljubljena kot sistem zdrave hrane ali prehrane za hujšanje.
Teorija ločene prehrane, ki je bila ustanovljena pred skoraj stoletjem, nakazuje pravo kombinacijo hrane ob enem obroku. Menimo, da za prebavo maščob, proteinov in ogljikovih hidratov telo potrebujejo različne encime: za prebavo živil ogljikovih hidratov - zahteva alkalno okolje, beljakovine pa zahtevajo kislo okolje. Tako, ko združevanje živil, ki so bogati z beljakovinami in ogljikovimi hidrati v enem obroku, vodi v nezadostno prebavo hrane in njeno gnitje, fermentacijo znotraj telesa.
Osnovna načela ločene prehrane kažejo, da se taki procesi razpadanja in fermentacije odstranijo tako, da se ogljikovi hidrati skupine proizvodov in proteinov ločijo drug od drugega. Tako je razumljivo, kaj pomeni ločiti hrano - to je sistem, ki strogo ureja združljivost proizvodov med seboj.
Pravila ločene prehrane pogojno razdelijo vse proizvode v beljakovine, maščobe in ogljikove hidrate ter strogo opredelijo vse možne različice njihovih kombinacij med seboj:
Očitno je, da so ločeni obroki prepovedi večine naših običajnih jedi in kombinacij. Vadite ločene jedi, ne morete jesti sendviče, pire krompir s kozarci, večina vrst solat. Tako ločena prehrana pomeni skoraj popolno spremembo vrste uživanja hrane za povprečno osebo.
Načela ločene prehrane trenutno niso pod znanstvenimi dokazi. Zdravniki verjamejo, da so procesi razpadanja in fermentacije na splošno možni le v človeškem telesu s hudimi boleznimi. Vendar pa so bili zavrnjeni tudi številni drugi postulati:
Kljub temu ima teorija ločene prehrane pravico do življenja. Številni njeni postulati se uporabljajo pri različnih vrstah prehrane za hujšanje in prinašajo rezultate.